超人神秘离去几年之后又回来了,但这时人们已经习惯没有超人的生活了。超人心痛地发现自己的女友已嫁他人;还有超人的死对头也在酝酿他的新阴谋:让超人永远失去超能力!面对打击和困难,超人为了让他所热爱的地球家园不被洪水毁灭,超人毅然下深海、上太空……拯救人类!
一直想寻根的超人(Brandon Routh饰)返回了氪星,希望可以找到其他同伴,但那里的一切早已不复存在。而这一去便是5年。5年后,超人回到了地球,但是周遭的一切已经改变。他发现地球已经习惯了没有超人的保护,他一直爱慕的路易丝(Kate Bosworth饰)因为馔写了一篇“为什么世界不需要超人”的报道而获得普利策大奖。更令他心碎的是,她已经与主编的侄子订婚,而且是一个5岁孩子的母亲了。另一边,他的死对头莱克斯(Kevin Spacey饰)利用卑鄙手段骗取了巨额遗产,企图卷土重来。在南极莱克斯找到了超人父亲的线索,以及一块含有超级能量的水晶,妄想借助水晶的力量控制地球。超人能否战胜心魔,再一次挽救地球于水火?